Sollte gehen - siehe hier: Codierung der Steuergeräte beim SGA I und II
Also mit VCDS - ob VAGCOM das kann, weiß ich nicht.
Ich würde das alte MSG noch einmal einbauen, Werte auslesen und dann eben die Werte eintragen. Zum Automatikgetriebe ist aber in dem Beitrag eben keine nähere Erklärung - deshalb altes auslesen und übertragen.