Pin 1, dicke Leitung rot (10,0 mm²) kommt von der Sicherung S164 (60A), ist dort mit 6,0 mm² angeschlagen, die Sicherung wird versorgt direkt von Batterie-Plus (im Sicherungskasten im Motorraum 
).
Pin 4, dicke Leitung schwarz (10,0 mm²) ist Masse und geht unterhalb der Batterie an die Karosserie.
Pin 3, dünne Leitung gelb (1,0 mm²) ist das PWM-Eingangssignal (Lüfterdrehzahl Anforderung).
Pin 2, dünne Leitung schwarz/gelb (1,0 mm²) geht an das Relais J151 für Pumpe für Kühlmittelnachlauf V51.
Die PWM Ansteuerleitung kommt vom J248 Motorsteuergerät, Pin 11, gelb, 0,35 mm². Irgendwo im Kabelbaum ist ein Verbinder für den Übergang des Leitungsquerschnitts.
Mit VCDS könntest du evtl. die angeforderte Lüftergeschwindigkeit aus dem MSG herauslesen. Ich weiß aber leider nicht, ob es das gibt und wenn ja, in welchem MWB.
Das Lüftersteuergerät selbst scheint mir eher nicht diagnostizierbar zu sein.